车辆发动机进水保险公司一般都会赔。不同保险公司保险条款不同，但对于发动机进水的赔偿分为两类：1、在行驶中进水或明知发动机进水的情况下启动汽车从而造成发动机损坏，保险公司不予赔偿；2、如果排气管进水而车主没有启动汽车。从事保险活动必须遵守法律、行规，尊重社会公德，不得损害社会公共利益。保险活动当事人行使权利、履行义务应当遵循诚实信用原则。保险合同成立后，投保人按照约定交付保险费，保险人按照约定的时间开始承担保险责任。保险合同成立后，投保人可以解除合同，保险人不得解除合同。
法律依据：《中华人民共和国保险法》 第十三条 投保人提出保险要求，经保险人同意承保，保险合同成立。保险人应当及时向投保人签发保险单或者其他保险凭证。
保险单或者其他保险凭证应当载明当事人双方约定的合同内容。当事人也可以约定采用其他书面形式载明合同内容。
依法成立的保险合同，自成立时生效。投保人和保险人可以对合同的效力约定附条件或者附期限。